Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sde2Q8K1J5 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms