Protein–RNA interactions for Protein: Q8CII8

Syne4, Nesprin-4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne4Q8CII8 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syne4Q8CII8 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms