Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms