Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hpf1Q8CFE2 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms