Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh13Q8CEE7 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms