Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc38Q8CDN8 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ccdc38Q8CDN8 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ccdc38Q8CDN8 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ccdc38Q8CDN8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ccdc38Q8CDN8 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc38Q8CDN8 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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