Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Atg4aQ8C9S8 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Atg4aQ8C9S8 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Atg4aQ8C9S8 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Atg4aQ8C9S8 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Atg4aQ8C9S8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Atg4aQ8C9S8 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Atg4aQ8C9S8 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4aQ8C9S8 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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