Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfibp1Q8C8U0 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms