Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8T8

Tsr2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr2Q8C8T8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tsr2Q8C8T8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tsr2Q8C8T8 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tsr2Q8C8T8 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tsr2Q8C8T8 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tsr2Q8C8T8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tsr2Q8C8T8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms