Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ubqln3Q8C5U9 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ubqln3Q8C5U9 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms