Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek11Q8C0Q4 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms