Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
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Ctdsp2Q8BX07 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Ctdsp2Q8BX07 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Ctdsp2Q8BX07 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Ctdsp2Q8BX07 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Ctdsp2Q8BX07 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Ctdsp2Q8BX07 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
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Ctdsp2Q8BX07 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Ctdsp2Q8BX07 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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