Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Usp38Q8BW70 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp38Q8BW70 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp38Q8BW70 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp38Q8BW70 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp38Q8BW70 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Usp38Q8BW70 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Usp38Q8BW70 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Usp38Q8BW70 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Usp38Q8BW70 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Usp38Q8BW70 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Usp38Q8BW70 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Usp38Q8BW70 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Usp38Q8BW70 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Usp38Q8BW70 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Usp38Q8BW70 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Usp38Q8BW70 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms