Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTQ0

PcgF3, Polycomb group RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcgF3Q8BTQ0 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PcgF3Q8BTQ0 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms