Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan12Q8BKT6 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms