Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc50Q810U5 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc50Q810U5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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