Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ChfrQ810L3 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms