Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Avl9Q80U56 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms