Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rexo1Q7TT28 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rexo1Q7TT28 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rexo1Q7TT28 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rexo1Q7TT28 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rexo1Q7TT28 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rexo1Q7TT28 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rexo1Q7TT28 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rexo1Q7TT28 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Rexo1Q7TT28 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Rexo1Q7TT28 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rexo1Q7TT28 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms