Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sgo2Q7TSY8 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms