Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2q1Q7TSS2 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms