Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ69

Tmc3, Transmembrane channel-like protein 3, mousemouse

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Length 1,130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc3Q7TQ69 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Tmc3Q7TQ69 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Gm45166-201ENSMUST00000209073 683 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Tmc3Q7TQ69 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tmc3Q7TQ69 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tmc3Q7TQ69 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tmc3Q7TQ69 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tmc3Q7TQ69 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tmc3Q7TQ69 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Tmc3Q7TQ69 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmc3Q7TQ69 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmc3Q7TQ69 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmc3Q7TQ69 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmc3Q7TQ69 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms