Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ScocQ78YZ6 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms