Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Topbp1Q6ZQF0 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Topbp1Q6ZQF0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms