Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms