Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smchd1Q6P5D8 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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