Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NipblQ6KCD5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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