Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sohlh1Q6IUP1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms