Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rftn1Q6A0D4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms