Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Msl2Q69ZF8 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
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Msl2Q69ZF8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Msl2Q69ZF8 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Msl2Q69ZF8 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msl2Q69ZF8 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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