Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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Lrrcc1Q69ZB0 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrcc1Q69ZB0 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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