Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Top2bQ64511 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms