Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Irf4Q64287 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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Irf4Q64287 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Irf4Q64287 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Irf4Q64287 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Irf4Q64287 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Irf4Q64287 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Irf4Q64287 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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