Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ift52Q62559 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms