Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Sycp1Q62209 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sycp1Q62209 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms