Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 824 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ift88Q61371 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms