Protein–RNA interactions for Protein: Q60931

Vdac3, Voltage-dependent anion-selective channel protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac3Q60931 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Vdac3Q60931 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Vdac3Q60931 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Vdac3Q60931 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vdac3Q60931 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms