Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp1r1bQ60829 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms