Protein–RNA interactions for Protein: Q60790

Rasa3, Ras GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa3Q60790 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rasa3Q60790 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms