Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms