Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms