Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWK7

Rnf145, RING finger protein 145, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf145Q5SWK7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf145Q5SWK7 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf145Q5SWK7 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms