Protein–RNA interactions for Protein: Q5F204

Mdh1b, Putative malate dehydrogenase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdh1bQ5F204 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mdh1bQ5F204 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mdh1bQ5F204 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mdh1bQ5F204 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mdh1bQ5F204 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mdh1bQ5F204 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mdh1bQ5F204 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mdh1bQ5F204 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mdh1bQ5F204 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mdh1bQ5F204 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mdh1bQ5F204 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mdh1bQ5F204 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mdh1bQ5F204 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mdh1bQ5F204 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mdh1bQ5F204 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mdh1bQ5F204 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mdh1bQ5F204 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mdh1bQ5F204 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mdh1bQ5F204 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mdh1bQ5F204 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mdh1bQ5F204 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mdh1bQ5F204 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mdh1bQ5F204 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mdh1bQ5F204 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mdh1bQ5F204 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mdh1bQ5F204 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mdh1bQ5F204 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mdh1bQ5F204 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mdh1bQ5F204 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mdh1bQ5F204 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mdh1bQ5F204 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mdh1bQ5F204 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mdh1bQ5F204 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mdh1bQ5F204 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mdh1bQ5F204 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mdh1bQ5F204 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mdh1bQ5F204 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mdh1bQ5F204 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mdh1bQ5F204 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mdh1bQ5F204 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mdh1bQ5F204 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mdh1bQ5F204 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mdh1bQ5F204 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mdh1bQ5F204 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mdh1bQ5F204 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mdh1bQ5F204 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mdh1bQ5F204 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mdh1bQ5F204 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mdh1bQ5F204 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mdh1bQ5F204 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mdh1bQ5F204 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mdh1bQ5F204 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mdh1bQ5F204 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mdh1bQ5F204 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mdh1bQ5F204 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mdh1bQ5F204 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mdh1bQ5F204 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mdh1bQ5F204 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mdh1bQ5F204 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mdh1bQ5F204 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mdh1bQ5F204 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mdh1bQ5F204 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdh1bQ5F204 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdh1bQ5F204 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdh1bQ5F204 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdh1bQ5F204 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdh1bQ5F204 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdh1bQ5F204 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdh1bQ5F204 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdh1bQ5F204 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdh1bQ5F204 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdh1bQ5F204 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdh1bQ5F204 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdh1bQ5F204 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdh1bQ5F204 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdh1bQ5F204 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdh1bQ5F204 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdh1bQ5F204 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdh1bQ5F204 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdh1bQ5F204 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdh1bQ5F204 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdh1bQ5F204 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdh1bQ5F204 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdh1bQ5F204 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdh1bQ5F204 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdh1bQ5F204 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdh1bQ5F204 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdh1bQ5F204 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdh1bQ5F204 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdh1bQ5F204 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdh1bQ5F204 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdh1bQ5F204 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdh1bQ5F204 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdh1bQ5F204 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mdh1bQ5F204 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mdh1bQ5F204 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mdh1bQ5F204 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mdh1bQ5F204 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mdh1bQ5F204 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mdh1bQ5F204 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms