Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pydc3Q3V3Q4 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms