Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC051142Q3V0M8 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms