Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Usp48Q3V0C5 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Usp48Q3V0C5 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Usp48Q3V0C5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp48Q3V0C5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp48Q3V0C5 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp48Q3V0C5 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp48Q3V0C5 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp48Q3V0C5 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp48Q3V0C5 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp48Q3V0C5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp48Q3V0C5 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp48Q3V0C5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp48Q3V0C5 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp48Q3V0C5 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp48Q3V0C5 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp48Q3V0C5 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp48Q3V0C5 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp48Q3V0C5 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp48Q3V0C5 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp48Q3V0C5 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp48Q3V0C5 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp48Q3V0C5 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp48Q3V0C5 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp48Q3V0C5 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp48Q3V0C5 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp48Q3V0C5 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp48Q3V0C5 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms