Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrfip1Q3UZ39 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms