Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms