Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b2Q3UJB0 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms