Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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